黑龙江大学自然科学学报

2021, v.38(02) 150-156

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基于组织特异性基因集权重的分析方法研究
Analysis method of tissue-specific gene set weight

田甜;王化琨;

摘要(Abstract):

基因集检验是分析高维基因组数据不可或缺的方法之一。虽然许多基因的表达和功能是组织特异性的,但是大多数基因集检验是以不区分组织类型的方式进行的。本文利用来自人类蛋白图谱中的组织特异性基因活性信息计算组织特异性基因的权重,并使用分子签名数据库中过滤后的基因集,生成了组织特异性基因集权重。为了证明这些权重的有效性,使用这些权重对三种疾病的基因表达数据进行了基因集检验,并对检验产生的p值进行加权。通过加权FDR分析发现,使用组织特异性基因集权重的加权方法可以提高基因集检验的统计功效,进而更准确地识别有关高维基因组数据在生物学上的基因集关联信息。

关键词(KeyWords): 基因集;组织特异性;权重;基因集检验

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12531496)

作者(Author): 田甜;王化琨;

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DOI: 10.13482/j.issn1001-7011.2021.01.203

参考文献(References):

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